Verifactu y factura electrónica, doble envío a Hacienda: los fiscalistas avisan de cartas por discrepancias y de más costes para el autónomo
Aedaf alerta del solape entre Verifactu y la factura electrónica: dos envíos de la misma operación, riesgo de requerimientos y costes extra de software.
El abogado autónomo que ya ha adaptado su programa de facturación a Verifactu puede encontrarse con una sorpresa: la factura electrónica obligatoria entre empresarios convive con ese sistema enviando la misma información por otro canal, y si los datos no coinciden, Hacienda llamará a la puerta. Es la advertencia que traslada Fernando Matesanz, miembro del Grupo de Expertos en el Impuesto sobre el Valor Añadido de la Comisión Europea y coordinador del grupo de IVA de la Asociación Española de Asesores Fiscales (Aedaf), en declaraciones recogidas por Autónomos y Emprendedores.
Dos canales para una misma factura
El mecanismo del solape es sencillo de explicar y costoso de soportar. Si una pyme presta un servicio a una empresa española y emite la factura con un programa en modalidad Verifactu, ese programa envía automáticamente a la Agencia Tributaria un registro con los datos de la operación. Al mismo tiempo, la normativa de factura electrónica exige remitir, también a la AEAT, una copia electrónica de la misma factura con los mismos datos que figuran en los registros de facturación.
Matesanz formula la objeción de fondo en nombre de Aedaf: qué sentido tiene introducir un sistema adicional como Verifactu, tal y como está diseñado actualmente, si la factura electrónica ya exige trasladar una copia fiel a Hacienda. La propuesta de los fiscalistas es que la información se transmita una sola vez y que sea la propia Agencia Tributaria quien la utilice para los distintos fines de control que considere necesarios.
El riesgo real: la rectificación mal comunicada
El problema práctico no está tanto en la emisión, que los programas pueden automatizar, como en la rectificación. Cuando una factura emitida se corrige y la modificación no queda reflejada correctamente en todos los canales, Hacienda recibe datos diferentes sobre una misma operación. Esa discrepancia puede traducirse en incidencias, requerimientos o comprobaciones que el contribuyente tendrá que aclarar, aunque el programa hubiera realizado los envíos sin intervención manual del empresario.
La solución, insiste el experto, no pasa simplemente por automatizar varios envíos, sino por evitar que tengan que producirse envíos duplicados. Mientras llega esa corrección, el autónomo soportará los costes de desarrollo, actualización y mantenimiento que los proveedores de software deberán asumir para atender exigencias distintas en formatos, procedimientos y plazos.
Calendario oficial y convergencia anunciada
El Ministerio de Hacienda anunció el 5 de octubre su intención de trasladar a octubre de 2028 las obligaciones pendientes del reglamento de sistemas informáticos de facturación, para alinearlas con la factura electrónica de autónomos y pymes, junto con una posterior modificación de ámbitos de aplicación y aspectos técnicos. Esa revisión exige modificar el Real Decreto 1007/2023, y Matesanz recuerda que, por ahora, hay una comunicación oficial pero falta aprobar y publicar la disposición correspondiente.
Las fechas que hoy maneja el profesional son las de la factura electrónica entre empresarios: 6 de octubre de 2027 para quienes superen ocho millones de euros de volumen anual de operaciones, 6 de octubre de 2028 para el resto, y 6 de octubre de 2029 para la obligación de informar sobre estados y pagos en el caso de personas físicas y entidades en atribución de rentas.
Qué preguntar antes de pagar por el software
La recomendación práctica para el despacho unipersonal es concreta: al elegir proveedor, distinguir la adaptación a Verifactu de las funciones necesarias para emitir y recibir facturas electrónicas conforme a la otra regulación, y preguntar por los formatos exigidos, la conexión con plataformas de intercambio, el envío de copias a Hacienda y la comunicación de los pagos. Una herramienta anunciada como adaptada a Verifactu podría necesitar nuevas funcionalidades o servicios adicionales con su coste correspondiente. Para quienes emiten pocas facturas, Matesanz recuerda una alternativa: la Agencia Tributaria ofrecerá una solución pública gratuita de facturación electrónica.
Una carga administrativa más que se suma a la cuota de autónomos de 2026 y su regularización, a la congelación de cuotas del RDL 31/2026 y a la gestión de dietas y kilometraje deducibles que ya soporta el colectivo.
Fuente: Autónomos y Emprendedores (29 de octubre de 2026).
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Fuentes
- autonomosyemprendedor.es. Consultada el 1 de noviembre de 2026.
Los datos concretos de este artículo proceden de las fuentes oficiales citadas.
